指導合作經濟發展戰略、發展規劃、企業改革、體制創新和基層供銷社的組織建設工作； 指導本系統參與農業產業化經營，發展專業合作社、專業協會、村級綜合服務社的建設和開放辦社等工作；指導所屬單位人員的專業技術業務培訓工作； 維護本系統社員的合法權益； 負責政策咨詢、 行業自 律、 項目申報、資金扶持、 品牌建設等服務工作； 負責下屬單位的安全生產的管理和考核工作；指導歸口管理的集體商業工作； 指導系統日用消費品、農業生產資料、農副產品、再生資源回收利用網絡建設； 指導系統各企業的工商登記、證照辦理等工作。